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特朗普政府于2026年4月6日发布2027财年预算提案，再度提出对美国主要科研机构实施大规模削减。国家科学基金会（NSF）、环境保护局（EPA）预算拟减半，国立卫生研究院（NIH）将被削减50亿美元中的50亿美元，国家技术与标准研究院（NIST）等机构亦面临超半数削减。预算文件以“绿色新骗局”等政治化措辞攻击气候变化研究，同时削减健康与环境差异研究项目，并推动将人工智能与量子技术作为优先领域。该提案与2026年版本高度相似，国会去年已拒绝类似提案，但政府仍坚持推进，显示其持续施压意图。尽管国会可能再次驳回，但行政机构可通过政策调整对科研体系造成实质干扰。
美国国会于2月3日通过2026财年预算法案，拒绝了特朗普政府提出的对科研预算的空前削减。然而，多项科研机构的拨款尚未完全释放。美国国家卫生研究院（NIH）尚未获得任何资金使用授权，国家科学基金会（NSF）上周才获准支出资金，而美国国家航空航天局（NASA）虽获全额授权，但对其十项特定项目施加了支出限制，这些项目此前曾被特朗普团队试图取消。白宫管理和预算办公室（OMB）被指是资金延迟释放的主要原因。
美国卫生与公共服务部长肯尼迪提名现任国家卫生研究院院长巴塔查里（Jay Bhattacharya）暂代疾病控制中心（CDC）主任职务，引发科学界和公共卫生专家强烈质疑。巴塔查里长期不直接管理NIH日常事务，却频繁参与政治宣传，其兼任两个关键机构可能加剧美国疫苗政策争议。